TopN predictive positions in HCV

These are the topN predictive positions for various subtypes (ranked by number of predictive positions):
Subtype 3a:

    'E2'    [ 95]
    'E2'    [  2]
    'E1'    [213]
    'E2'    [222]
    'E2'    [ 93]
    'E2'    [212]

Subtype 2a:

    'E2'    [  2]
    'E2'    [109]
    'E2'    [  1]
    'E2'    [226]
    'E2'    [225]
    'P7'    [ 20]

Subtype 1a:

    'E2'     [  2]
    'E2'     [ 85]
    'E2'     [187]
    'E2'     [  1]
    'E2'     [  6]
    'E2'     [180]
    'E2'     [176]
    'E2'     [ 83]
    'E2'     [ 82]
    'E2'     [186]
    'E2'     [ 16]
    'E1'     [ 43]
    'E2'     [245]
    'P7'     [ 20]
    'E2'     [175]
    'NS2'    [119]
    'E1'     [105]
    'NS2'    [  2]
    'P7'     [ 26]
    'NS2'    [ 29]

As you can see the positions are "similar" and there are some overlaps.